广东省心血管病研究所成立于1958年，前称广东省胸腔疾病研究所。二十世纪七十年代初，在敬爱的周恩来总理的直接关怀下，组建了一支以我所心脏外科医生为主的队伍，赴阿根廷进行医学考察，这批专家回国后即积极开展工作，成为当时国内最早恢复心血管疾病科研和临床的单位，为我国心血管医学事业的发展起到了具有深远意义的带动作用，并由此带来了研究所腾飞的时代。
全所现有职工503人。职称结构：高级职称 91 人，中级职称131 人，初级职称245人。学历结构：博士29人，硕士55人，学士80人。享受政府特殊津贴的知名专家16人。开放病床380张。
研究所现有科室如心血管内科、心血管外科、心血管儿科、心血管病门诊部、放射介入科、心脏康复科、麻醉科、流行病学研究室、冠心病重点研究室（省重点）、风湿性心脏病临床研究重点实验室（省重点）、心血管临床药理研究室（省重点）、心血管分子生物学研究室。
稳定和高质量的医疗服务是研究所临床医疗工作的一大特色，科技创新与学术交流带动了临床医疗工作，特别在瓣膜病、冠心病、先天性心脏病及高血压等的诊治方面，研究所一直走在国内的前列。七十年代后期，研究所在国内率先开展的“人工心脏瓣膜置换术”、“冠状动脉大隐静脉搭桥转流术”、“小儿人工心脏瓣膜置换术”等等，代表着当时国内较高水平。八十年代初，本所在国内最早开展“经皮穿刺气囊导管心脏瓣膜成形术”，这种技术被誉为“20世纪心血管医学里程碑式的革命”。九十年代的心电生理射频消融术，小儿先天性心脏病介入治疗技术以及冠心病介入治疗等技术，本所不但是国内较先开展的单位之一，而且一直保持在国内领先水平 。近年来，介入性心脏病治疗技术不断创新，外周大血管、颈动脉、肾动脉介入治疗等已成常规，介入治疗手术与外科手术相结合的“嵌入式”治疗，增加了复杂心脏病的手术机会，提高了对该类疾病的治疗水平，这是本研究所的特色之一。
研究所也是高级心血管医学人才的培养基地。1978年我所成为国务院授予的全国第一批硕士学位授权单位，1981年又成为国务院授予的全国首批博士学位授权单位，现有内科心血管、外科心血管、儿科心血管、肿瘤学四个硕士点以及外科心血管和内科心血管两个博士点，2004年设立了博士后工作站。目前拥有博士生导师9名，硕士生导师25名；已培养博士61名、硕士118名、出站博士后11名；现有在读博士生28名、硕士生52名、在站博士后4名。从1978年开始，研究所受卫生部委托举办“全国心血管学习班”，招收全国各地医院主治医师以上的专业人员进行为期一年的专业培训。至今已举办30期，共有1125名学员毕业。这些学员现都成为各地医院的医疗骨干，有不少人成为医院领导和当地学科带头人。
经过五十年的努力，研究所在心血管疾病的预防和临床医学研究领域形成了自己的特色和优势，成为我国南方规模少有水平较高的心血管病医学研究中心。将继续努力，不断探索、不断创新，为心血管疾病的医学研究和临床诊疗作出更大的贡献。